หากรุ่นแรกของ Seat Cordoba ใช้ชิ้นส่วนจำนวนมากที่มีโฟล์คสวาเก้นโปโล 3 รุ่นที่สองทำสิ่งเดียวกันกับรุ่นที่สี่ของโปโลเช่นเดียวกับ Skoda Fabia ที่ได้รับหลายเครื่องยนต์และแชสซี คอร์โดบาใหม่นี้มีให้ในการกำหนดค่าเครื่องยนต์หลายรายการเริ่มต้นด้วย 12 วาล์วขนาด 1.2 ลิตรและสิ้นสุดด้วย 2.0 ลิตร อสังหาริมทรัพย์และรุ่นรถเก๋งไม่รวมอยู่ใน Cordoba รุ่นที่สองอีกต่อไปซีดานเป็นเพียงรสชาติที่มีอยู่เท่านั้น เปิดตัวในปี 2003 การส่งออกของ Cordoba ในสหราชอาณาจักรถูกหยุดในปี 2549